Tsukiji Balık Pazarı'nda çalışan genç bir balıkçı olan Yuta, bir gün talihsizlik yaşadı ve hazırlanmış yemeğini kazara elinden kaçırdı. Yemeğinin, Sumida Nehri'nin derinliklerinde kaybolmasını izledi. Bu görünüşte önemsiz olayın, hayal gücünün ötesinde bir olaylar zincirini başlatacağını bilmiyordu. Haftalar sonra, aynı nehrin derinliklerinden, mutasyona uğramış bir yaratık ortaya çıktı. Kalamara benzeyen bu devasa yaratık, bir zamanlar canlı olan Tokyo şehrini kasıp kavuran devasa dokunaçlarıyla öne fırladı. En gelişmiş silahlarıyla donatılmış Japon Öz Savunma Kuvvetleri, şehri korumak için yaratığı yiğitçe devreye soktu, ancak çabaları böylesine ezici bir güç karşısında boşunaydı.
