UC 0105 ve yıkıcı İkinci Neo Zeon Savaşı'nın üzerinden on iki yıl geçti. Dünya ve kolonileri nihayet barışa kavuştu ve insanlar hayatlarını ve toplumlarını yeniden inşa etmeye başladı. Ancak, kırılgan dengeyi bozacak yeni bir tehdit ortaya çıktığından, güçlükle kazanılan bu barış kısa ömürlü olur. Bu tehdit, Dünya Federasyonu'nun Dünya'yı özelleştirmesini ve onu ayrıcalıklıların oyun alanına dönüştürmesini engellemeye kararlı bir terör örgütü olan "Mafty" biçiminde gelir. Önde gelen Mafty, ünlü Federasyon Kaptanı Bright Noa'nın oğlu Hathaway Noa'dan başkası değil. Hathaway aynı zamanda hedeflerine ulaşmak için kullanmayı planladığı güçlü bir mobil giysi olan deneysel RX-105 Gundam'ın pilotudur.