Filmin adından ve afişinden de ipucu bulabileceğimiz üzere Benedetta rahibe bir kadının yaşadıklarına odaklanan bir hikâyeye sahip. Benedetta isimli rahibe, işindeki hassasiyeti ile ünlenip çok kısa bir zaman diliminde Toskana bölgesinde bulunan bir manastırın başına yetkili olarak getirilir. Burada da kısa sürede ilgi ve saygı görmeye devam eder. Ancak bu saygıyı kendi elleriyle bozacaktır. Çünkü Benedetta, başka bir rahibe ile cinsel bir ilişki yaşamaktadır ve bu kısa bir süre sonra açığa çıkacaktır. Sonrasında ise müebbet hapis cezasına çarptırılır. Filmi en çarpıcı kılan özellik, hikayesinin uzun yıllar önce yaşanmış gerçek bir hikâyeye dayanmasıdır.